所谓“妹妹”，其实是突显主角“兄”（即读者）的象征性。在原作版上并没有一个实际的“兄”的存在，大概是希望读者能代入其中享受“妹妹”的爱之余也能爱护“妹妹”。原作版上12个“妹妹”每一个都是独立的存在。改编动画和游戏时才将“兄”实体化。在游戏中玩家可选择“妹妹”是否有血缘关系。
在1999年三月，杂志出版社MediaWorks（现称ASCIIMediaWorks）所出版的杂志电击G's杂志推出一个名为“妹妹公主”的读者参与计划。当时“妹妹”的数量只有九个。在2000年时，根据当时读者意见再加入由德国、英国与法国回到日本的三个新“妹妹”。2001年3月8日，游戏版于PlayStation主机发售。在2001年及2002年两度动画化，不过两套动画妹妹公主和妹妹公主RePure剧情并不相连。
剧情简介
男主角海神航，是一个麻木不仁、只为学业奋斗的少年。故事一开始在烦嚣的东京，正是考试放榜的日子，航和他的同窗兼朋友灿绪去看成绩，一心想着胜利是理所当然的他，却发现榜上没有他的编号！
原来是因为选错多项选择的答案了。于是学校考不上，而一直照顾航的管家，亦要离他而去！正当事情达到这样糟糕的时候，突然两神秘人出现，说恭喜航受推荐入读一间神秘学校，而该学校竟在一个神秘的岛上——PromisedIsland......航本来万分不愿意，但因毫无选择，只好出发，到了岛上，发现处处透着古怪，除了不断看到貌似管家的老人，扮成不同角色在航的身边出现外，最骇人听闻的是，十二位美丽可爱的女孩，先后出现，还自认是航的妹妹！就是这样，航就在这岛上，和十二个不同性格的“妹妹”住在一起，揭开他人生中最华丽的一页......
同时，另一位叫真深的女孩，冒认是航的第十三位妹妹，混入WelcomeHouse中和航给妹妹们一起居住，藉以监察航的一举一动，她更时常和一神秘人作电邮通信，他们的目的是让小航回到毫无希望的东京。
原作中总共有12个“妹妹”。每个“妹妹”均根据其出生日期的星座反映其性格。
人物介绍
- 可怜（可憐（かれん），配音演员：桑谷夏子（日）；周文瑛（港）；杨凯凯（台））
- 9月23日出生，处女座，身高148CM。算是12个妹妹中的“领袖”。富家出身，温柔清纯，擅长弹钢琴。对“兄”的称呼为“お兄ちゃん”。
- 花穗（花穂（かほ），配音演员：望月久代（日）；何璐怡（港）；谢佼娟（台））
- 1月7日出生，魔羯座，身高143CM。比较活泼的“妹妹”，经常为“兄”打气，行动稍为笨拙。对“兄”的称呼为“お兄ちゃま”。
- 卫（衛（まもる），配音演员：小林由美子（日）；张颂欣（港）；杨凯凯（台））
- 10月18日出生，天秤座，身高150CM。活跃健康的“妹妹”，体育万能唯独球类略差，第一人称是多为男性使用的仆（ぼく）的仆娘。对“兄”的称呼为“あにぃ”。
- 咲耶（咲耶（さくや），配音演员：堀江由衣（日）；曾秀清（港）；陶敏娴（台））
- 12月20日出生，射手座，身高159CM。被誉为最成熟“妹妹”，但仍保留一点任性，有潮流触觉。动画和游戏中设定为年纪最大的“妹妹”。对“兄”的称呼为“お兄様”。
- 雏子（雛子（ひなこ），配音演员：千叶千惠巳（日）；林雅婷（港）；许淑嫔（台））
- 8月15日出生，狮子座，身高132CM。可爱的小“妹妹”，动画和游戏中设定为“妹妹”之中年纪最小。对“兄”的称呼为“にいたま”。
- 鞠绘（鞠絵（まりえ），配音演员：柚木凉香（日）；梁少霞（港）；冯美丽（台））
- 4月4日出生,白羊座，身高148CM。病弱“妹妹”，爱读书，饲养一只金毛寻回犬。对“兄”的称呼为“兄上様”。
- 白雪（白雪（しらゆき），配音演员：冰青（日）；曾佩仪（港）；许淑嫔（台））
- 2月11日出生，水瓶座，身高140CM。爱料理的“妹妹”，自称“公主”（姬），经常为“兄”创作新菜式。对“兄”的称呼为“にいさま”。
- 铃凛（鈴凛（りんりん），配音演员：神崎ちろ（日）；黎桂芳（港）；谢佼娟（台））
- 7月9日出生，巨蟹座，身高152CM。进取的“妹妹”，理科万能，自己曾经制作一只“铃凛机器人”，对“兄”的爱毫不隐藏。对“兄”的称呼为“アニキ”（兄贵、老哥）。
- 千影（千影（ちかげ），配音演员：川澄绫子（日）；谢洁贞（港）；谢佼娟（台））
- 3月6日出生，双鱼座身高157CM。沉默寡言，神秘的“妹妹”，原作中她亦是“兄”前世的妹妹，擅长塔罗牌占卜。对“兄”的称呼为“兄くん”。
- 春歌（春歌（はるか），配音演员：嘉数由美（日）；朱妙兰（港）；许淑嫔（台））
- 后加的三个“妹妹”之一。5月16日出生，金牛座，身高156CM。和风“妹妹”，从德国回来，对薙刀、茶道等日本传统甚有研究，目标是成为“兄”的“大和抚子”。对“兄”的称呼为“兄君さま”。
- 四叶（四葉（よつば），配音演员：半场友惠（日）；黄玉娟（港）；陶敏娴（台））
- 后加的三个“妹妹”之一。6月21日出生，双子座，身高149CM。从英国回来，开朗的“妹妹”，非常注意“兄”的一举一动，经常说要“检查”“兄”的一切，数码相机或放大镜为随身物。对“兄”的称呼为“兄チャマ”。
- 亚里亚（亞里亞（ありあ），配音演员：水树奈奈（日）；陈凯婷（港）；杨凯凯（台））
- 后加的三个“妹妹”之一。11月2日出生，天蝎座，身高139CM。不谙世事，害羞的“妹妹”，由法国回来，非常爱哭，平常总带着一枝洋伞，蓬蓬裙和缎带是亚里亚的特征之一，12个妹妹中最擅长唱歌的一位。对“兄”的称呼为“兄や”。在RePure中总叫家里的管家“爷爷”。
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