游戏是让你建造、收集舰娘们，并和深海栖舰在海上战斗。
玩家(游戏中被称为提督)需要收集以航空母舰、战舰、巡洋舰、驱逐舰等军舰为原型拟人化之后的少女舰娘们，编成单队最大6艘（2017年秋季活动出现可编成7艘的第三游击部队）的舰队来与敌人进行战斗并取得胜利。游戏系统为集换式卡牌类型+策略型游戏的组合形式。
每位舰娘的立绘采用了该舰船的装备等带有该舰船特色、特征的描画，战斗时使用的基础数据也是根据史实海战战历来进行简单的体现。舰娘装备的主炮等武器装备也是根据实际的装备进行设计的。游戏中的各海域名称虽然是架空的，然而也是根据史实地名进行加工，让玩家们能够猜想到该海域是史实上的哪一块海域以及该海域曾经有过怎样的海战。玩家们所在的服务器名称，则是采用了太平洋战争期间IJN（旧日本海军）所实际拥有的镇守府，泊地等来命名。
游戏开始时玩家能够获得一艘初始舰娘以及少量资源，之后需要通过建造来获得新的舰娘，或者通过击败敌方舰队来获取掉落舰娘。获得的舰娘可以通过击败敌方舰队来进行升级，还可以通过将其他舰娘作为材料合成来强化基础数据，装备更强力的武装来强化自身等方式进行养成，从而壮大提督自己的舰队。达到一定练度的舰娘可以通过改造系统来变得更加强力。改造的时候，有的舰娘会由于历史事件，舰种发生改变。还有一部分舰娘能够进行两种状态之间的互相切换，被称为「コンバート改装」。然而，一部分的舰娘在改装时需要消耗改装设计图，更有比如翔鹤型，改二时除了改装设计图之外还需要消耗试制甲板弹射器这样的特殊道具。舰娘的练度上限是99，但是可以通过婚约书&戒指（每艘舰娘需要消耗掉一个），将练度上限提升至175。这个练度上限提升被称作结婚（假）。
一部分舰娘只能通过消耗大量资材的大型舰建造系统来入手。而且这些舰娘的出现率比通常建造能够获得的舰娘要低的多。因此，在进行大型舰建造之前会有专门的窗口提示各位提督，大建有风险，不建议通过氪金买资源大建。
燃料、弹药、钢材、铝土，这4种资源是舰娘的建造，修理，运用等活动中必不可少的。资源会随着时间推移自动回复，同时可以通过出击，远征，以及课（氪）金物品来入手。
每个玩家都可以通过完成每日，每周，每月任务来获得燃料，弹药等的补给。同时，完成任务获得的奖励还包括舰娘，课金道具等。
舰娘们有各自的固定耐久值，小破时图标会冒出黑烟，中破以上立绘会发生变化（衣物破损，武装被毁坏等）。耐久值降到0则会被轰沉，留下遗言之后消失在深海里（lost）。虽然有办法防止舰娘被轰沉，然而被轰沉的舰娘没有手段可以复活，只能通过养一艘新船来代替。同时，舰娘被轰沉时所搭载的装备也会一起被破坏。耐久力并不会自然回复，只能通过消耗燃料和钢材，以入渠的方式进行修理。每个舰娘根据不同的损伤程度，修理耗时各不相同。不过可以通过使用高速修复材料来缩短修理时间。
敌方舰队被称为深海栖舰，是由一群来路不明的军舰和运输舰所组成的舰队。期间限定活动等一部分高难度的战斗海域里出现的深海栖舰会以鬼、姬、要塞等特殊舰种形式出现，并自带特殊的登场效果以及语音。
舰队Collection的世界观，包括舰娘和深海栖舰之间战斗的理由，这一切都是一个未解之谜，游戏也不存在【剧情模式】，一部分设定会在跨媒体作品中体现出来，然而这些设定有时是相去甚远乃至互相矛盾的。或者在一些同人作品中有关于舰队的世界观和战斗的理由。不过各有春秋，分歧有一定的大小。
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