山内房治郎时期
任天堂成立于1889年9月23日，初任社长为山内房治郎，成立时称作“任天堂骨牌”，主要生产花札。“任天”取“谋事在人、成事在天”之意。
1902年，任天堂制造了日本最早的扑克牌。
山内积良时期
1929年，山内房治郎的女婿山内积良出任第二任社长。
1947年，成立了“株式会社丸福”。
山内溥时期
1949年，山内积良的孙子山内溥出任第三任社长。
1951年，改名“任天堂骨牌株式会社”，主营纸牌等业务。
1959年，获得迪士尼授权，生产迪士尼形象的纸牌。
1963年，改名“任天堂株式会社”（现名），开始涉足其他领域。
1968年，任天堂成立了游戏部门。横井军平设计了光线枪、超级怪手等玩具，在日本引起了较好的反响。
1977年，任天堂与三菱电机合作，发行家用游戏机Color TV-Game 6、Color TV-Game 15，开始进军电子游戏行业。
1978年，开始开发并发售街机。
1980年，掌上游戏机Game & Watch发售。同年，美国任天堂（Nintendo of America Inc.）在美国纽约成立。
1981年，街机游戏《森喜刚》发售，这也是任天堂当家角色马力欧首次登场。
1983年，家用游戏机Family Computer发售，由于主机为红白两色，在中文圈也被称为“红白机”。该机型是任天堂首次尝试卡带式家用游戏机平台，同时任天堂开始寻求第三方合作。任天堂采用了权利金制度确保游戏质量，但也为厂商带来一定负担。
1985年，FC游戏《超级马力欧兄弟》发售，该作取得了巨大的成功。同年，FC在北美发售，为了避免受到1983年美国游戏业大萧条的影响，任天堂将其以“Nintendo Entertainment System”（任天堂娱乐系统）的名义销售。
1989年，掌上游戏机Game Boy发售。为了降低成本增加续航，该机型使用了单色液晶屏。其同捆的游戏《俄罗斯方块》也获得了很好的销量。
1990年，家用游戏机Super Famicom发售，在中文圈也被称为“超级任天堂”。任天堂曾试图与索尼合作为SFC加入光驱，但最终合作取消，索尼转而自行研发PlayStation。
1991年，任天堂在台湾地区设立了溥天股份有限公司（后改名为任天堂溥天）。
1995年，VR游戏机Virtual Boy发售。由于技术限制，该机型的画面仅有红黑两色，未能被大部分玩家接受。VB的失败间接导致了横井军平离开任天堂。
1996年，家用游戏机Nintendo 64发售。任天堂在该平台发售了《超级马力欧64》《塞尔达传说 时光之笛》等3D游戏，为3D游戏开发提供了范例。
1998年，掌上游戏机Game Boy Color发售。该机型是GB的改进版，提供了彩色屏幕，而同时期发售的GBC游戏大多兼容使用GB游玩。
2001年，掌上游戏机Game Boy Advance发售。该机型相比于GBC提供了更大的画面分辨率。此外，部分GBA卡带搭载了特殊感应器，可以实现游戏中的不同功能。
同年，家用游戏机Nintendo GameCube发售。
岩田聪时期
2002年5月24日，山内溥退休，岩田聪出任第四任社长。
同年，神游科技（iQue）成立，负责中国大陆地区任天堂相关产品的引进和发行。
2004年11月21日，掌上游戏机Nintendo DS发售。该机型并未沿用“Game Boy”品牌，采用了双屏设计，下屏为触摸屏。得益于岩田聪主导的“蓝海策略”，NDS和随后发行的家用游戏机Wii获得了大量轻度玩家的支持。
2005年4月7日，任天堂在香港设立了任天堂香港有限公司。
2006年12月2日，家用游戏机Wii发售。该机型采用了独特的手柄设计，开创了电子游戏的体感热潮。
2011年2月26日，掌上游戏机Nintendo 3DS发售。该机型沿用了NDS的双屏设计，并加入了裸眼3D的功能。8月11日，3DS降低售价，任天堂宣布将以“大使计划”补偿此前购买的玩家，但此举还是引发了许多玩家的不满。
2012年4月26日，任天堂公布上一财年财报，自80年代公开财报以来首次亏损。
12月8日，家用游戏机Wii U发售。该机型吸取了双屏设计的想法，使用GamePad作为手柄。但因定位不当、性能落后等原因，未能得到市场广泛认可。随后任天堂加快了新主机的研发。
2013年9月19日，任天堂前任社长山内溥因肺炎逝世，享年85岁。
2014年4月7日，任天堂溥天与任天堂香港发表公告称，任天堂溥天的在台业务将交由任天堂香港负责。任天堂溥天则于5月31日结束营业解散。
2015年3月17日，任天堂宣布将与DeNA合作，双方通过股权换购成为合作伙伴。
2015年7月11日，岩田聪因胆管癌病逝，享年55岁。任天堂于7月13日发布讣告，并宣布由竹田玄洋和宫本茂暂时代理公司事务。
君岛达己时期
2015年9月14日，君岛达己出任第五任社长。竹田玄洋与宫本茂分别担任新设立的“技术理事”（技術フェロー）和“创意理事”（クリエイティブフェロー）职务。
2016年11月30日，任天堂宣布与环球影城合作，开设任天堂主题乐园超级任天堂世界，最先在日本大阪建设，随后于美国洛杉矶和佛罗里达建设。
2017年3月3日，家用游戏机Nintendo Switch发售。该机型彻底放弃了对Wii U兼容，其定位为“便携式家用游戏机”。
古川俊太郎时期
2018年6月28日，古川俊太郎出任第六任社长。
2019年4月26日，任天堂宣布与腾讯合作，在中国大陆发行Switch主机。
同年7月10日，掌上游戏机Nintendo Switch Lite发售。该机型为Switch的掌机模式。
2021年3月18日，日本大阪环球影城的超级任天堂世界开放。其原定于同年2月4日开放，后因新冠疫情延期。
4月7日，任天堂香港在台湾地区成立分公司。
6月2日，任天堂宣布将在宇治小仓工场建立“任天堂资料馆”（暂名），用以展示任天堂的开发历史及理念，预计在2023财年完成建设。
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